EUDI-lompakko on kehitetty täyttämään korkeat vaatimukset turvallisuuden, tietosuojan ja luotettavuuden osalta. Teknisissä eritelmissä noudatetaan periaatteita “security by design” ja “privacy by design”, joten turvallisuus- ja tietosuojanäkökohdat otetaan huomioon jo kehitystyössä. EUDI-lompakossa käytetään sertifioituja turvamekanismeja ja nykyaikaisten älypuhelinten suojattuja alueita arkaluonteisten tietojen ja salausavainten suojaamiseksi. Käyttäjät hallitsevat identiteettitietojaan ja päättävät itse, mitä tietoja he jakavat viranomaisten, yritysten tai muiden organisaatioiden kanssa. Lisäksi EUDI-lompakko tukee tietojen säästämismenettelyjä, joissa luovutetaan vain ne tiedot, joita todella tarvitaan. Tavoitteena on tehdä digitaalisista identiteeteistä turvallisesti käytettäviä ja suojata samalla käyttäjien yksityisyys parhaalla mahdollisella tavalla.