Peněženka EUDI byla vyvinuta tak, aby splňovala vysoké požadavky na bezpečnost, ochranu dat a důvěryhodnost. Technické specifikace se řídí zásadami “security by design” a “privacy by design”, takže aspekty bezpečnosti a ochrany dat jsou zohledněny již při vývoji. Peněženka EUDI využívá certifikované bezpečnostní mechanismy a chráněné oblasti moderních chytrých telefonů k ochraně citlivých údajů a kryptografických klíčů. Uživatelé si zachovávají kontrolu nad svými identifikačními údaji a sami rozhodují o tom, jaké informace budou sdíleny s úřady, společnostmi nebo jinými organizacemi. Peněženka EUDI navíc podporuje postupy pro úsporu dat, při nichž jsou zveřejňovány pouze skutečně potřebné informace. Cílem je umožnit bezpečné používání digitálních identit a zároveň co nejlépe chránit soukromí uživatelů.